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Questo studio combina etichettatura di prossimità e modelli strutturali innovativi per mappare la composizione e l'architettura dei complessi epigenetici CRKT e NuA4 in *Trypanosoma cruzi*, fornendo nuove basi per lo sviluppo razionale di farmaci contro la malattia di Chagas.
Questo studio presenta la prima mappa completa dell'espressione della proteina whirlin in tutto il corpo umano, rivelando la sua presenza diffusa in tessuti endocrini, riproduttivi, nervosi e in specifici tipi cellulari, fornendo così una risorsa fondamentale per indagare le sue funzioni oltre l'udito e la vista.
Questo studio identifica i fibroblasti sinoviali come bersagli primari dell'inibizione JAK nel trattamento dell'artrite reumatoide, delineando come specifici sottotipi cellulari e meccanismi di segnalazione citochinica influenzino l'efficacia terapeutica e i limiti di sicurezza dei farmaci JAK inibitori.
Questo studio dimostra che in *Chlamydomonas reinhardtii* l'autofagia indotta dalla fame avviene indipendentemente dal complesso ATG1, sfidando il modello canonico dipendente da tale complesso.
Lo studio integra dati omici multi-specie per identificare una popolazione conservata di cellule interstiziali valvolari attivate, localizzata nelle regioni vulnerabili delle valvole mitraliche, che guida il rimodellamento fibrotico nella degenerazione valvolare mixomatosa e rappresenta un potenziale bersaglio terapeutico.
Lo studio rivela che la composizione dei domini transmembrana delle proteine SNARE, caratterizzata da un arricchimento di residui di fenilalanina nelle vie secretorie precoci e di isoleucina in quelle tardive, si è adattata evolutivamente alle diverse proprietà fisico-chimiche delle membrane per garantire la corretta localizzazione subcellulare.
Questo studio presenta un approccio basato su modelli fondazionali genomici, ottimizzati con tecniche di adattamento a basso rango (LoRA), che consente il rilevamento diretto e accurato degli array CRISPR sia da sequenze genomiche frammentate che da letture metagenomiche senza necessità di assemblaggio, superando le limitazioni degli strumenti tradizionali nel gestire ripetizioni degeneri e dati a lettura corta.
Utilizzando la tomografia crioelettronica in situ, gli autori hanno risolto la struttura dei reticoli citoplasmatici negli embrioni di mouse, rivelando che sono complessi macromolecolari di 4,5 MDa contenenti assemblaggi di ligasi E2-E3 carichi di ubiquitina che svolgono un ruolo cruciale nella modificazione post-traduzionale durante lo sviluppo embrionale precoce.
Lo studio dimostra che l'accoppiamento dei moduli Core e Chinasi del fattore di trascrizione TFIIH, mediato dalla subunità Tfb3, è essenziale per localizzare e limitare la fosforilazione della CTD di RNA polimerasi II alla fase iniziale della trascrizione, poiché la loro separazione porta a una fosforilazione disordinata lungo l'intera regione trascritta.
Questo studio rivela che la differenziazione sessuale nel network circadiano della *Drosophila* è guidata da profili trascrizionali dimorfici in specifici sottotipi di neuroni, che regolano la connettività sinaptica verso i neuroni pC1/pCd-1 attraverso molecole di adesione cellulare specifiche per sesso, collegando così l'orologio biologico ai comportamenti dimorfici.
Questo studio dimostra che in *Bacillus subtilis* la risoluzione dei conflitti testa-coda tra replicazione e trascrizione richiede l'attività elicasi del complesso AddAB per processare le forche di replicazione invertite, permettendo il ripristino dell'integrità del fork e la ripresa della sintesi del DNA.
Questo studio dimostra che la modulazione epigenetica mirata, veicolata tramite nanoparticelle lipidiche LUNAR(R), supera le strategie di editing basate su nucleasi e deaminasi, garantendo una soppressione duratura e clinicamente rilevante della PCSK9 nel fegato.
Lo studio dimostra che in *Bacillus subtilis* l'espressione di proteine transmembrana induce uno spostamento fisico del gene corrispondente dal nucleotide alla membrana plasmatica, fornendo la prima evidenza diretta del processo di "transertion" e confermando il coupling funzionale tra trascrizione e traduzione anche nei batteri Gram-positivi.
Lo studio rivela che PARP1 disassembla direttamente i nucleosomi evictando asimmetricamente i dimeri istonici per generare esoniomi parzialmente PARilati, un meccanismo cruciale per l'accessibilità della cromatina e la riparazione del DNA che dipende dal C-terminale di H2A.
Lo studio rivela che DAXX utilizza moduli effettori distinti per separare l'assemblaggio dei nucleosomi H3.3 dal silenziamento degli ERV, dimostrando che il reclutamento di repressori SUMO-dipendenti, e non la deposizione di H3.3, è il meccanismo primario di repressione.
Questo studio presenta un protocollo completo e standardizzato per l'isolamento di nuclei di alta qualità dal cuore umano congelato, che supera le limitazioni delle metodologie attuali garantendo una resa superiore e riducendo la variabilità tecnica per le analisi di sequenziamento dell'RNA a singolo nucleo (snRNA-seq).
Il paper introduce ProAR, un nuovo framework di modellazione autoregressiva probabilistica che genera traiettorie di dinamica molecolare di lunghezza arbitraria catturando l'incertezza conformazionale e riducendo gli errori cumulativi, superando le prestazioni dei metodi esistenti nella generazione di traiettorie a lungo termine.
Lo studio dimostra che il pirfenidone migliora la steatoepatite associata all'obesità e la disfunzione del tessuto adiposo modulando il rimodellamento adiposo dipendente da mTORC1, riducendo la lipogenesi nel grasso sottocutaneo e la fibrosi nel grasso viscerale, con conseguente miglioramento della patologia epatica.
Lo studio identifica la proteina SON come un fattore critico che, reclutando complessi di splicing sui siti di giunzione deboli e ricchi di C, garantisce l'efficienza dello splicing di geni con architettura GC-alta, rivelando come l'evoluzione del dominio disordinato di SON abbia permesso di salvaguardare l'espressione di questa classe genica.
Questo studio dimostra che l'assenza di ATM compromette il controllo della replicazione del DNA in risposta a danni ossidativi endogeni, generando lacune nelle catene figlie che richiedono la riparazione per ricombinazione omologa e rendendo le cellule sensibili agli inibitori di PARP.